《旁篇》二十五卷
医经共七家，一百七十五卷，可惜除了《黄帝内经》，其余六家全都散佚不存。据《艺文志》定义，“医经者，原人血脉经落(络)骨髓阴阳表里，以起百病之本，死生之分，而用度箴石汤火所施，调百药齐(剂)和之所宜。至齐(剂)之得，犹磁石取铁，以物相使。拙者失理，以愈为剧，以生为死。”我们今天所见之《黄帝内经》，内容与之完全相应，可以肯定，就是《七略》所辑《黄帝内经》。
既然《黄帝内经》书目著于《汉书·艺文志》，且未说不存，说明东汉班固那个时代还能见到此书。到了东汉末年，张仲景著《伤寒杂病论》，序中云“勤求古训，博采众方，撰用《素问》、《九卷》、《八十一难》、《阴阳大论》、《胎胪药录》，并《平脉辨证》，为《伤寒杂病论》合十六卷。”仲景未称《黄帝内经》，惟言《素问》《九卷》，尚不知二者关系。后世很多学者认为仲景为伤寒学派，与《黄帝内经》无涉，实际《伤寒论》之六经辨证，是从《素问·热论》中脱胎而来，二者关系密切。读书不多不明之人，乃有割裂之论。
西晋时名医皇甫谧撰《针灸甲乙经》，序中称“《七略·艺文志》，《黄帝内经》十八卷。今有《针经》九卷，《素问》九卷，二九十八卷，即《内经》也。”皇甫谧去仲景未远，其言当有所本。说明东汉时医家已将《黄帝内经》分作两部分，一部分以论析医理为主，一部分以经络针灸为主，前者名之以《素问》，后者署名不定，或直称《九卷》如仲景，或称《针经》如皇甫谧。从此《黄帝内经》分为两部，两部命运亦各有起伏。
西晋末年，五胡乱华，中原板荡，衣冠图籍随之南渡。东晋时，《黄帝内经》或《素问》之名未曾出现于史册。南朝时有一人名 全元起，注解了《素问》，他曾就砭石一事造访王僧儒，依此当为齐梁时人。其作注释，以训诂为主，朴实无华，是已知《黄帝内经》的最早注本。《隋书?经籍志》载“《黄帝素问》八卷，全元起注，今亡。”说明隋唐之际，此书已不存。唐朝的王冰，宋朝的林亿，校正《素问》时所见全元起注本，只是断简残编，宋以后全部湮没无闻。从一些引文我们可以看到全元起对《素问》之名的解释：“素者，本也;问者，黄帝问岐伯也。方陈性情之源，五行之本，故曰《素问》。”
隋朝的杨上善撰《黄帝内经太素》三十卷，将《黄帝内经》的内容分为数十类如“摄生、阴阳、藏府、经脉、诊候”等等，以类汇编条文，依次注解，极具特色，其内容包括今之《素问》《灵枢》。据传杨上善是道士，隋炀帝大业年间为太医侍御。他的《黄帝内经太素》在《旧唐书?经籍志》《新唐书·艺文志》中都有存目。宋代林亿校正《素问》时，此书尚在。大约在南宋时散佚，中国无由得见。此书在日本一直有流传，当是唐朝时遣唐使带去，1825年左右，日本人在京都仁和寺发现了《太素》古抄本，较为完备，日本学者参阅各本进行整理，得二十三卷，并刊刻发行，清末学人杨守敬赴东瀛访书，遂将刊本带回。时隔千年，中国医者方得再见《黄帝内经太素》。
《素问》流传过程中，贡献最著者当属唐代的王冰。王冰，号启玄子，亦是道家人物，雅好医药，潜心研究《素问》十二年之久，感慨《素问》“世本纰缪，篇目重叠，前后不伦，文义悬隔”，确实，《素问》经过口耳相传，之后录于竹简、布帛，接着钞于纸本卷子，损坏、佚失、错简、误字等实属难免，王冰决定重新进行校勘整理。《素问》当时第七卷已不存，王冰自称从他处得先师张公秘本以补入，这部分就是“运气七篇”。他经过分合增删，《素问》由原来的九卷变为二十四卷，并重新调整篇目次序，每篇冠以名称，于唐代宗宝应元年(762年)完成《补注黄帝内经素问》。我们今天所看到的'《素问》，完全以王冰的本子为基础，从篇目可知，王冰将道家的观念贯穿其中，对后世影响很大。
《隋书?经籍志》载：“《素问》九卷，《针经》九卷。”说明隋唐之际，《灵枢》仍然以《针经》之名流传。王冰注解《素问》时，在自序中说：“《黄帝内经》十八卷，《素问》即其经九卷也，兼《灵枢》九卷，乃其数焉。”其注文也大量引用《灵枢》。这是《灵枢》这个名称的最早记录。但当时《灵枢》篇目似已不全。
唐末五代，战乱频仍，图书之厄不及备载。北宋初期，朝廷重开献书之路。宋朝皇帝，特别重视医学。北宋嘉祐二年(1057年) ，仁宗皇帝诏令编修院置校正医书局，命集贤院、崇文院学士带领医官，对历代重要医籍进行搜集整理、考证、校勘，并予以出版。校正医书局堪称世界最早的国家卫生出版机构。高宝衡、林亿负责校正《素问》，林亿等人搜集了当时流传的多种《素问》古本，决定以王冰的《补注黄帝内经素问》为底本，参考《难经》、《脉经》、《针灸甲乙经》、《素问》全元起注本、《黄帝内经太素》等，进行极为严谨的校勘，“正谬误者六千余字，增注义者两千余条，”所增所减，必详明出处缘由，最后撰成《重广补注黄帝内经素问》。北宋已兴雕版印刷之术，朝廷下令将此书刊印发行，流传天下，从此《素问》再无散佚之虞。宋以后医家注解《素问》皆本于此。
林亿在校正《素问》时指出：“按今《素问》注中引《针经》者，多《灵枢》之文，但以《灵枢》今不全，故未得尽知也。”表明，北宋时《灵枢》已难窥全貌。林亿注《素问》时，又引《九墟》《九灵》之文，内容多与《灵枢》重合，当是《灵枢》在民间流传时的别称，其别称也颇具道家色彩。
北宋哲宗元佑七年(1092年)十二月，高丽国派使臣朝贡，并献书于宋廷，其中有一部《黄帝针经》。高丽更有所求，希望天朝准许其购买中国历代史籍及《册府元龟》等书。时任端明殿学士兼礼部尚书的苏轼上书，认为不宜许，史书包含历代兴亡治乱之理，又兼山川地理形势，不可遗他国。苏轼从朝廷安危考虑，很有道理。然而哲宗皇帝于元佑八年(1093年)正月下诏颁布高丽国所献《黄帝针经》于天下，显然已经答应了高丽的请求。此《黄帝针经》有九卷，乃完本，于是《灵枢》也得以刊刻流传。北宋末年，靖康之难，中原又遭金人荡涤，到南宋建立时，官方已不见《黄帝针经》。绍兴二十五年(1155年)，四川成都的史崧献出家藏旧本《灵枢》，当是北宋所刻《黄帝针经》的后继本。史崧所献《灵枢》后经南宋朝廷刊印发行，流传至今，就是我们现在看到的《灵枢》。今本《灵枢》对比《黄帝内经太素》及王冰注《素问》所引《灵枢》条文，都能相合，差别极小，确为《灵枢》真本。
宋以后，《黄帝内经》之《素问》《灵枢》再未失传，研究并注释《内经》的医家层出不穷。金代刘完素研究《素问》三十五载，对原文进行阐发，著有《黄帝素问宣明论方》《素问玄机原病式》。元代的滑寿研究《素问》颇有心得，著《读素问抄》三卷。明代的马莳，字玄台，对《素问》《灵枢》原文逐篇逐段加以注解，并阐发精义，撰成《素问注证发微》《灵枢注证发微》两书。马莳擅长针灸，对《灵枢》的注释更加精妙，对后人启发不少。之后明代的吴昆亦对《素问》进行全文注释，著有《素问吴注》二十四卷。明末张介宾穷三十年之力，撰成《类经》三十二卷。他将《素问》《灵枢》内容按主题重新编排，分为十二大类，三百九十节，逐次注释，条理井然，便于查阅，其方法与隋朝杨上善不谋而合。张介宾集历代注家之要，参以己见，很多注解极为精要，对后世影响很大。明末清初的李中梓，编有《内经知要》，将《内经》的内容节选分类，加以注解，如《类经》的简要版，颇受后世学医者的欢迎。
清初张志聪仿照历代注释儒家经典的方法，与其门人汇集各家注解，著有《黄帝内经素问集注》、《灵枢经集注》，亦颇有影响。此后又有高世栻的《黄帝素问直解》，姚止庵的《素问经注节解》，汪昂的《素灵类纂约注》，黄元御的《素问悬解》《灵枢悬解》，皆可资参考。 日本的丹波元简著有《素问识》《灵枢识》，专门挑出《内经》中的难解之处进行注释，在学界评价很高。
《黄帝内经》能保存至今，历代医家都为此付出过大量心血，今我梳理其本末，见者当知华夏医学之源远流长，亦知经典流传之不易，愿读《黄帝内经》者能惜之!
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