化学化工学院：化学（含海洋化学方向）、化学工程与工艺
海洋地球科学学院：地质学（海洋地质学方向）、勘查技术与工程（地球探测与信息技术方向）、地球信息科学与技术
工程学院：土木工程、工程管理、港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程、工业设计、机械设计制造及其自动化、自动化
经济学院：金融学、国际经济与贸易、物流管理、海洋经济学
环境科学与工程学院：环境科学、环境工程
材料科学与工程系：材料化学、高分子材料与工程
法政学院：法学、政治学与行政学、公共管理类（公共事业管理、行政管理）
体育系：运动训练专业（本科）
鱼山校区：
海洋生命学院：生物科学类（生物科学、生物技术、生物化学与分子生态学）、生态学
水产学院：水产养殖学、海洋生物资源与环境、海洋渔业科学与技术
食品科学与工程学院：食品科学与工程、生物工程
数学科学学院：数学与应用数学、信息与计算科学
医药学院：药学
教育系：教育技术学
艺术系：音乐表演
浮山校区：
管理学院：工商管理类（工商管理、会计、财务管理、市场营销、电子商务、旅游管理）
外国语学院：英语、日语、朝鲜语、法语、德语
文学与新闻传播学院：汉语言文学（含动漫文学方向)、文化产业管理、新闻传播学类（新闻学、编辑出版学）