考生取得毕业证书时，市考办会将毕业证书与学籍档案材料原件一起发到考生手中，考生要自行存放学籍档案。有工作单位且单位有存放人事档案部门的自考毕业生，可将学籍档案材料及时送单位人事部门，而对于没有工作单位的考生，可将学籍档案材料原件存放街道办事处、当地派出所或人才交流中心等有权存放人事档案的部门代管，与自己的人事档案归在一起，一定不要自己拿着，你的学籍档案应是人事档案的一部分。
在高校研究生录取过程中，有的自考生个人手持自考档案办理调档工作，这是不允许的。考生应该了解每个人的档案都与自己今后升学、就业、提职、出国等有着极其密切的关系，不能忽视自己档案的存放问题。自学考试的学籍档案也叫考籍档案，主要包括《毕业生登记表》和《考生毕业审定表》，内容涉及考生姓名、专业、区县、第一次参加考试时间、准考证号、填表日期、曾用准考证号、身份证号码、其他身份证件号、联系电话、本人简历、奖惩情况、自我总结、单位鉴定、初审及复审等信息。