学校前身是1906年清政府创立的暨南学堂；1927年更名为国立暨南大学；1949年合并于复旦大学、交通大学等高校；1958年重建。
截至2020年11月，学校在广州、深圳、珠海有五个校区，校本部在广州市石牌；校园占地总面积214.30万平方米，建筑面积170.20万平方米；设有37个学院和研究生院、本科生院，26所附属医院，其中三甲医院11所；有国家“双一流”建设学科1个，国家二级重点学科4个、国务院侨办重点学科8个、国家中医药管理局重点学科2个、广东省一级学科重点学科21个、广东省二级学科重点学科14个；12个学科进入ESI世界排名前1%。