近年来，随着电子计算机的普及、网络技术的飞速发展，我国各高校的会计核算基本实现了会计电算化。计算机代替手工记账、算账，改变了传统的会计核算方式，从而对手工记账模式下的会计系统控制体系产生了一系列的冲击，使高校内部会计系统控制与会计核算电算化的矛盾日益凸显。为保证会计数据的真实性和完整性。
一、会计系统控制概述
会计系统是为确认、汇总、分析、分类、记录和报告单位发生的经济业务，并保持相关资产和负债的受托责任而建立的各种会计记录手段、会计政策、会计核算程序、会计报告制度和会计档案管理等的总称。会计系统控制是单位实施内部会计控制活动的重要手段，是保证会计资料真实完整的关键。关键控制点有以下几个方面：
会计人员岗位责任控制。
要求高校建立会计人员岗位责任制，在会计机构内部规定各项会计工作岗位的职责和权限，把有关规定、要求等具体落实到每一会计工作岗位，以责定权，责权分明，严格考核，有奖有惩，切实做到事事有人管，人人有专责，办事有要求，工作有检查。 会计档案控制。会计档案是高校经济活动在会计核算中的综合反映，会计系统控制要求高校财务机构对会计档案的收集、整理、鉴定、编目、查阅、交接和有效利用等形成一整套的规章制度。 会计信息控制。要求对高校的所有经济业务都要及时、准确、系统、完整地予以反映并进行监督，从而保证会计信息的质量。
(1)会计凭证控制要求高校所有的经济事项都必须获得合法的.原始凭证，经专人审核符合真实性、完整性要求后才能作为编制记账凭证的依据，还要在记账凭证的填写、记账、过账、传递、签章等方面加以控制，保证会计凭证的真实性和完整性;
(2)会计账簿控制要求高校按国家统一的会计制度规定设置会计账簿，按时间顺序将审核无误的记账凭证内容分类记入账簿，并在会计账簿启用、登记、更正、对账和结账等各环节进行控制，使单位的经济活动得到全面、连续、系统的记录;
(3)财务会计报告控制要求高校严格以审核无误的会计账簿为编制依据，准确、完整、及时反应高校一定时期财务状况和事业发展成果。
二、会计电算化对会计系统控制的影响
实现会计电算化，由电子计算机代替手工记账、算账，改变了传统的手工会计核算方式而大幅度提高会计工作效率，同时也给会计系统控制带来了新的问题和挑战
增加了会计系统控制的对象。手工会计系统是通过授权、审批、不相容职务相分离等方法对财务人员实施控制。实现会计电算化后，财务人员只负责原始数据的收集、审核、录入记账凭证数据，账簿记录、编制会计报表等工作由计算机系统处理。这样，会计系统控制由对人的控制转变为对人和计算机的控制。
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